Бастапқы кезеңде өнімнің бөлінуінің басты мақсаты – өнімнің маңызды бөлігінің өнімін ажыратып, тағы әртүрлі қоспаларды ажыратуға болады. Сондықтан, жоғары сапалы биоөнімдерді алу үшін, оларға өнімдерді тазарту кезеңін қосады. Бұл кезеңін маңызы – қоспалардан тазартып, өте таза өнімді шығарады.
Осы таза өнімдерді алу әр – түрлі процестер арқылы шешіледі және көбісін біз бұрын қарастырған болатынбыз. Оларға экстрация және экстрагирование, адсорбция, иондық алмасу, ультрафильтрация және кері осмос, ректификация және ферментолиз. Бұлардан басқа тағы процестерді қолданады, олар:
Хромотография – адсорбцияға ұқсас процесс. Қатты сорбентте ерітінді заттар жиналады, тек біреу ған емес олардың саны көп болып келеді және олардың құрылымы жиі ұқсас болады. Мысалы, белок қоспалары, нуклеотидтер, қанттар, антибиотиктер. Адсорбция кезеңінде бірге десорбуются етеді. Ал хроматография кезеңінде олар сорбенттан рет-ретімен шығып, оларды бөлінуге және бір-бірінен тазалауға ықпал етеді.
Диализ – бұл процесс жартылай өткізгіш ара қабырға кіші молекулалы заттарды өткізеді, ал үлкен молекулалы заттар өте алмайды қалады. Диализ жолы арқылы вакциналар мен ферменттерді тұздан және кіші молекулалы ерігіш қоспалардан тазартады.
Кристализация. Бұл процесс түрлі ерігіш заттарды, әр – түрлі температурада тазартады (базируется). Температураны баяу түсуі кристалдар мақсатты өнім ашпаларын (растворов) қалпына келтіреді және тазалығы өте жоғары болып келеді. Мысалғы осындай жолмен кристалды пенициллин алынады.